Química
[Ensino Superior] Software para desenho de estruturas químicas
Submetido por EscolasLivres a Terça, 05/05/2009 - 21:06.Destacamos neste artigo três programas livres para desenho de estruturas químicas: são eles, o BKChem, o GChemPaint - Chemical Structures Editor, e ainda o JChemPaint.
Em química e áreas afins é necessário muitas vezes desenhar simbolicamente estruturas químicas, simples ou complexas. Por exemplo, com a finalidade de ilustrar um dado trabalho académico ou científico. Existem editores 2D ou 3D. Os três programas que indicamos são editores 2D.
O BKChem permite exportar os desenhos para formatos úteis como ODF, PNG, PDF, SVG. A lista completa de funcionalidades pode ser encontrada aqui. Captura de ecrã:
O JChemPaint, por sua vez, é escrito em Java, como tal tem a particularidade de que o editor pode ser integrado numa página web. A lista de funcionalidades encontra-se aqui. Também tem a possibilidade de exportação para formato Postscript (rapidamente convertível para PDF) e SVG. Captura de ecrã:
A página do gChemPaint refere-nos para a página do Gnome Chemistry Utils. Como a página não contém muitas informações sobre o programa, o melhor é mesmo explorá-lo e descobrir as suas funcionalidades. Captura de ecrã:
O BKChem (Python) e o JChemPaint (Java) são multiplataforma, isto é, podem ser usados em Windows, Linux, Mac OS, e possivelmente noutros sistemas operativos. O GChemPaint destina-se ao ambiente gráfico Gnome, associado a ambientes Linux/Unix.
Nos repositórios Debian/Ubuntu encontra o BKChem e o GChemPaint, pelo que a sua instalação nestas distribuições de Linux é muito fácil. Poderá procurar os programas por exemplo no Synaptic. Relativamente ao JChemPaint, terá de possuir um ambiente Java para executar o programa, que é distribuído como ficheiro .jar (Java executável). Os ficheiros necessários para o colocar a funcionar como applet web são distribuídos dentro de um ficheiro .zip.
Jmol - visualizador 3D de estruturas químicas
Submetido por EscolasLivres a Terça, 04/14/2009 - 09:37.
Jmol |
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O Jmol é um visualizador 3D de estruturas químicas. De acordo com o artigo "Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue" publicado no períodico "Biochemistry and Molecular Biology Education", o Jmol pode servir para investigação básica de estruturas biomoleculares e para a implementação de actividades de nível médio ou avançado para alunos. O Jmol pode ser usado no desenvolvimento de páginas web educativas compatíveis com qualquer navegador ou sistema operativo, através de applets JAVA. As suas funcionalidades de visualização são completamente adequadas para biomoléculas, de pequena ou grande dimensão. sendo também aplicável em campos como a cristalografia, ciência dos materiais, química orgânica e inorgânica. Notas: para executar o Jmol fora do navegador web deverá ter um ambiente JAVA instalado, abrindo o ficheiro Jmol.jar; a segunda captura de ecrã foi retirada desta página, onde poderá outros exemplos. Discuta aqui. |
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| Plataformas suportadas: | Sítio web da aplicação: | |||
| Windows | Mac | Linux | Unix | jmol.sourceforge.net/ |
Microscópio Virtual
Submetido por EscolasLivres a Quarta, 01/07/2009 - 13:51.O Microscópio Virtual é um projecto financiado pela NASA que fornece uma simulação (simples) de um microscópio. As amostras disponíveis para visualização no microscópio são cerca de 90, abrangendo diversos campos do conhecimento. Por exemplo, é possível ver pó lunar ou marciano; uma vulgar mosca; uma pedra formada num rim; um circuito integrado; ou células do sangue humano, entre muitas outras!
O Microscópio Virtual, que é disponibilizado mediante uma licença livre (University of Illinois/NCSA Open Source License), pode ser obtido neste endereço, estando disponível para diversas plataformas, como Windows, Mac OS, Linux, Unix, etc.
As cerca de 90 amostras disponíveis, foram obtidas com mais de 70 000 imagens, que totalizam 62.2 Gigapixéis e ocupam 174GB. Dado o espaço que as amostras ocupam, apenas algumas vêem juntamente com o ficheiro de instalação do Microscópio Virtual. O programa apresenta as amostras disponíveis e se necessário descarrega a informação necessária da internet.
Ao testarmos a Versão para Linux, executámos os comandos:
> unzip VirtualLab6.2.2-with-samples.zip
> cd Virtual\ Lab
> ./ApplicationLauncher.jar
Para iniciar a aplicação, deverá repetir as instruções que surgem, incluindo uma barra "\" em "Virtual\ Lab", ou seja:
>java -Dapple.laf.useScreenMenuBar=true -Djava.library.path=resources/ -Xmx1024m -jar /home/NOMEUTILIZADOR/virtualmicrosc/Virtual\ Lab/resources/Virtuallab.6.2.2.jar Finished loading /home/NOMEUTILIZADOR/virtualmicrosc/Virtual\ Lab/resources/Virtuallab.6.2.2.jar
substituindo NOMEUTILIZADOR pelo seu nome de utilizador.
Ao executar o programa aparece a janela seguinte com uma listagem de amostras:
Escolhemos investigar a amostra de um meteorito. Depois de serem descarregados cerca de 500MB de dados, pudemos então explorá-los, num interface semelhante ao seguinte:
Mudando de amostra, por exemplo, para "areia da Costa Risca" (Costa Rican Sand), ficam disponíveis outro tipo de funcionalidades, devido à utilização de outro tipo de microscópio:
Note que a aplicação está disponível apenas em inglês. Mais informação sobre os microscópios e sobre a preparação de amostras para os mesmos pode ser obtida na página do projecto.
Os responsáveis do projecto garantiram-nos de que novas versões do software (diga-se, bastante simples!) estarão focadas essencialmente em correcção de pequenos problemas, pelo menos no curto prazo. Quanto aos dados disponíveis, estão à procura de disponibilizar novas amostras em breve, algumas provenientes do Museu de História Natural de Londres.
Software para estudo da tabela periódica - Kalzium
Submetido por EscolasLivres a Sábado, 11/10/2007 - 10:19.
Kalzium |
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A aplicação livre Kalzium pertence ao conjunto de aplicações educativas do projecto KDE. O Kalzium permite-lhe estudar os elementos químicos da tabela periódica e a própria tabela periódica. Possui ainda outras funcionalidades como um glossário, informação histórica, ferramenta de análise gráfica, etc. * Disponível em breve nestas plataformas (KDE > 4.x) |
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| Plataformas suportadas: | Sítio web da aplicação: | |||
| Windows* | Mac OS* | Linux | Unix | http://edu.kde.org/kalzium/ |












